、教会中受过教育
人开始质疑腐朽中世纪学说，其中就包括罗马教义中关于地球形状、大小、位置和在宇宙中运动学说。麦哲伦让世人对地球大小、海洋和陆地分布有
清醒认识。其他人提出问题，而麦哲伦提供答案，并且他答案还必将引申出更多问题——这种质疑即使在21世纪也还在持续。
西班牙国王对这次航行结果并不满意，他原本希望西班牙国旗能在摩鹿加群岛升起，从而打破葡萄牙对东方香料（丁香、肉豆蔻、肉桂和胡椒）贸易垄断。香料可以制成珍贵防腐剂，但香料贩卖也带来
些其他恶劣影响，比如可以甚至是经常用来掩盖变质肉所散发出来气味。当局鼓励和支持香料贸易，实际上，也是在毒害自己国家人民。这是探险带来负面影响。此外，中世纪欧洲人对疾病几乎没有什
抵抗力。探险者和船员将欧洲病菌带到遥远地方，感染当地人。而他们返航后，在没有任何检查情况下又将外面疾病带回，并且传播到整个欧洲。
这幅《死亡之舞》（DanceofDeath）由德国制版名家迈克尔·沃格姆特（MichaelWolgemut）制作，是于1493年德国出版《纽伦堡编年史》（NurembergChronicle）书中幅木版画。死亡之舞，或者骷髅之舞，是中世纪文艺作品中个常见主题，当时人们生活非常艰苦，寿命也很短，死亡简直随处可见。死亡对当时人来说是最大平等，每个人都虔诚地活着，等待着那天到来。
有时流行病来源可以快速确定。斑疹伤寒以前从未在欧洲出现过，然而随着西班牙军队在塞浦路斯打败摩尔人回国后，伤寒席卷阿拉贡王国。然而更多疾病源头无从查起。没有人知道1495年那不勒斯爆发欧洲第次梅毒起源，以及同年英格兰遭受严重“汗热病”来源——“旦患上这种疾病，存活率只有百分之。”16世纪史学家拉斐尔·霍林斯赫德（RaphaelHolinshed）写道——也没有人知道黑死病具体起源。这种病1347年10月由热那亚船队带回来，当时船队从东方回到墨西拿港，很快所有船员都患上种综合淋巴炎、肺炎以及败血病多种病症疾病，并最终都不治身亡，之后欧洲每20年就会经历次黑死病爆发。但可以肯定是，15～16世纪欧洲人都笼罩在瘟疫阴影中，随时都有丧命危险，而这种恐惧也在定程度上打消探险者去探索未知世界念头。
疾病死亡人数直在增加——每天晚上挖墓人马车都会经过街道，车夫边赶车边叫喊：“把没气人抬出来！”当时历史学家这样写道。德国所有城镇似乎都变成被遗弃墓地，到处哀嚎遍野——所有迹象表明，整个社会似乎已经迷失方向。在某些方面，这是人类有史以来最糟糕时代——个充满背叛、绑架、手足相残、堕落、野蛮以及虐待时代。在英格兰，根据国王颁布法令，星法院注21把无罪人送上绞刑台，这些人临死之前都不知道自己冒犯谁、犯什罪。在洛伦佐·德·美第奇（Lorenzode
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