创办之初，最让曾国藩伤脑筋
是清朝军事补给制度。清朝在夺得政权后，各方面都沿用明朝制度，明朝体制很多短处，清朝仍旧没有改变，相反还变本加厉。清朝军事供应和政事参合为
元，军队粮饷补给，不是来自中央财政，而是来源于地方z.府零碎供应。按理说，户部是国家财政中枢，应该统筹全局，但实际上户部却等同于个大型会计机构，只是在账目上监督各个机关和各地方z.府出纳。各个地方z.府按照规定数额把给养直接运送到各个军事单位。在供给上，各级z.府各自为政，有就干脆采取拖延方式。这种军事供给方式，给部队统筹带来
巨大困难。曾国藩湘军在供给上面临问题就更大，因为湘军还不算是朝廷正规军。在这样情况下，身为钦差大臣曾国藩最费精力件事就是，不得不硬着头皮与各式各样大小官吏打交道，软硬兼施，才能得到不足额供给。
曾国藩故居
各种困难遭遇让曾国藩对于清朝现实状况有个透彻解，对于这种制度本质，曾国藩看得比先前清楚得多。曾国藩豁然明白个现实，那就是，中国千百年直奉行是文官制度，在这种制度下，那种知识优越感以及在这种制度下享受便利，使得中国精英
人人不杀都胆壮，各各逃生寻去向。
贼要聚来
要做，贼要掳来要放。
每人给张免死牌，保你千妥又万当。
往年在家犯过罪，从今再不算前账。
不许县官问陈案，不许仇人告旧状。
种种苦情说不完，说起阎王也心酸。
今到处贴告示，凡是胁从皆免死。
第不杀老和少，登时释放给护照。
第二不杀老长发，尺二尺皆遣发。
第三不杀面刺字，劝他用药洗几次。
家骨肉再团圆，九重皇恩真浩荡。
言普告州和县，再告兵勇与团练。
若遇胁从难民归，莫抢银钱莫剥衣。
曾国藩湘军就是这样“不伦不类”。这支人员结构复杂军队就是以这种独特方式，投入这场战争，与另外支同样也堪称“不伦不类”太平军，进行生死殊杀。
当然，湘军创办从开始就不是帆风顺。在地方上，湘军还没有成形，各式各样阻挠就已经出现——那些平庸巡抚、布政司和按察司们，他们直试图掣肘曾国藩，在他们阻挠下，曾国藩每次行动，都显得艰涩而困难。这些大大小小官吏们既胆小怕死，又怯懦怕事，但他们都有副忠于职守、老实忠厚面具。对于他们来说，再也没有比在唯唯诺诺面具下遮掩妒贤嫉能实质而感到更有乐趣。这些人掌握粮食和供给，从开始，他们就不断给曾国藩出难题。曾国藩在长沙招兵买马时，那些打仗怕死绿营兵甚至闯进曾国藩大营，差点跟曾国藩兵勇打起来。为顾全大局，曾国藩只好将自己湘军移至衡阳，避免跟绿营直接接触，全力训练自己部队。
第四不杀打过仗，丢军器便释放。
第五不杀做伪官，被胁受职也可宽。
第六不杀旧官兵，被贼围捉也原情。
第七不杀贼探子，也有愚民被驱使。
第八不杀捆送人，也防乡团捆难民。
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