还是信不过袁世凯，当初让袁世凯代理直隶总督和北洋大臣，只不过是为
安抚袁世凯，让他服下
粒“定心丸”。
很快，直隶总督兼北洋大臣裕禄来天津上任。袁世凯交出关防大印，重新回到小站。小站
周围，也就是天津芦台带，布满新调来董福祥甘军和宋庆毅军。派军牵制袁世凯同时，慈禧又以取消原定天津阅兵理由，给袁世凯部送来奖赏新建陆军白银四千两，以示体恤。袁世凯不失时机递交个奏折，表明自己效忠。紧接着，袁世凯又向慈禧上另道奏折，对洋人武装力量随意进京事，作提醒，并提出应对办法。不久，慈禧连续几次召见袁世凯，袁世凯也向慈禧作军事上建言。袁世凯毕竟是个能臣，对于军事尤其在行，他有条不紊、思路敏捷以及对中外军事力量洞察，给慈禧留下深刻印象。袁世凯危机初步解除。1899年朝廷考核当中，朝廷发出上谕，对于袁世凯训练新建陆军三年，给予较高评价。
让慈禧觉察到袁世凯有过人能力，是袁世凯处理山东日照起排外事件。1899年4月，德国工程师三人在山东日照被当地民众殴伤，德国以此为借口，侵占沂州、日照等地，沿途烧杀抢掠。朝廷命袁世凯率所部，由天津开赴德州带实行保护。在德州那段时间，袁世凯接连给朝廷上好几个奏折，论证中国病因以及根治办法，再次引证甲午中日战争数十万中国军队溃千里惨痛教训，提议在东北各省增练五万新军，加上原有北洋武卫军五万人，就可以达到十万人，以这样军事实力，国家防卫力量会有个明显改观。袁世凯还提议，让自己参考模仿各国军事，详拟兵法、操法、军规、器械等方面章程，请旨颁发各省军营，体遵照执行。慈禧当然同意袁世凯这请求，对于慈禧来说，她这辈子心结，就是练兵。现在，出现袁世凯这样现代军事人才，慈禧当然很高兴。袁世凯很快拟定有关军事要略，上报朝廷下发；还撰写《训练操法详晰图说》计十二册，另附阵图等，呈送朝廷。主要内容包括：战法、战规、行军、攻守、驻扎等，步兵、炮兵、骑兵、工程兵操法、阵法、战法，并插绘许多简明图解，附录各种章程、条规、饷章、格式等。后来，朝廷正式出版这部军事著作，下发全国作为训练新军军事教科书。
到这个时候，袁世凯在戊戌变法中所受到怀疑和冷落，算是彻底烟消云散。这个冷静而精明中原汉子，又次凭着自己机智和冷静涉险过关。在危险和灾难面前屡屡逃脱，让袁世凯徒增很多勇气，也平添更多信心。
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