危险渡海求佛法。七月二日那天，他在长江河口附近上岸后先滞留在扬州，等待文宗皇帝颁发
入境许可证明，
等就是半年时间，他和辛谠就是在这段时间认识。其实辛谠对佛法并不热衷，但是圆仁远从异国来唐求法精神却令他甚为感动，所以在生活起居上提供不少支援。
其后，圆仁还到过五台山佛教圣地修行，于开成五年八月抵达大唐京城长安。未料二年后，就遇上历史上有名“会昌废佛”风潮。
在中华文长久历史中，经常发生这类悲惨事件。在位高权重者煽动下，少数派遭到诬陷迫害，难以数计文化宝藏被无情摧残，“会昌废佛”就是非常有名例子之。
会昌二年（西历八四二年）十月，二十八岁武宗皇帝颁布敕令，强迫国内僧尼还俗。翌年，大权在握宦官仇士良去世。仇士良生前为
贡因自己势力，暗中进行各种阴谋勾当，包括谋害皇族二名、后妃名、宰相四名。但是这位横,bao恶名昭彰恶徒，惟独对佛教崇拜有加，对外国来僧众更是礼遇，所以仇士良死对外来和尚而言，无疑是大打击。
仇士良死后，他遗族和随从遭到逮捕处刑，万贯家产也被没收充公。所谓“种什
样因，得什样果”，长安城百姓对仇家下场莫不拍手叫好。只是，长安城并没有因仇士良死而回复平静，反而连番发生严惩祝融肆虐，其中，六月场大火更造成四千户民家烧毁巨大损失。
会昌四年（西历八四四年），武宗正式下令“朕痛恶佛法，下令烧光天下所有佛书、坏毁天下所有佛寺。”到这时期，“会昌废佛”运动正式如火如荼地展开。
在这场浩劫中，大唐帝国境内被捣毁大寺庙有四千六百座、小寺庙四万座、强制还俗僧尼有二十六万人，拒绝还俗者律处死，寺院土地和财产全数遭到没收，情况级为惨烈。
唐朝朝廷向来以信奉道教为主，但是对其他宗教多半采取宽容怀柔政策，长安因此成为汇集百教大城市。既然如此，为何年轻武宗会下达如此严酷废佛敕令？据说，废佛事件是位叫赵归真道士在幕后主导，他怂恿武宗宣布废佛令。但话又说回来，此时佛教确早已百病丛生，弊端连连。寺庙不仅拒绝向z.府纳税，还向信众们收取布施、收购土地、囤积财富，不少出家僧众沉溺酒肉女色。武宗之所以强制没收寺院土地和财产，来既可充实国库，二来也可借此废佛运动，整肃堕落佛教界。
但若以励精图治角度来说，武宗手段未免失之极端严苛，不仅铲除异已，甚至连中立派，或是批评者也遭到诛连命运。“十八史略”中描述武宗为人“豪迈果断”，是位充满英雄霸气年轻皇帝，只是旦失去分寸，容易流于刚愎自用，发不可收拾。
这场废佛风潮造成长安城,bao徒横行、寺院遭无情摧毁，佛经被焚烧、宝物被掠夺、僧尼死伤更是无数。焚烧寺院火舌经常波及到附近民宅，这也是长安城在这段时间，接连不断发生大火灾肇因。“即使是处国僧尼也不能例外，律令其还欲，违者处死”，就是这道敕令，圆仁被迫离开长安，回到祖国日本。
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