米剌印率兵自西宁出南路西进，沿途捕杀叛军
侦骑并消灭其留守部队，神不知鬼不觉地进入柴达木河上游地区。很快顺军探知固始汗大营在乌兰穆和尔，米剌印便率军连夜拔营疾行，直捣和硕特军大营。
当顺军抵达蒙军营帐时，固始汗部属尚未起床，人不及衣，马未衔勒。顺军分四路发起突然袭击，蒙军猝不及防，仓皇逃散，溃不成军。
固始汗见大势已去，便服下毒药试图z.sha，但被周围侍从抢救
下来。很快顺军攻破和硕特军营帐，顺军先锋赵自牢杀入帐中，由于
些蒙古兵极力抵抗，乱战之中，赵自牢即命令所部卫兵放排枪将固始汗等和硕特部重要王公并打死。
此役顺军彻底击溃和硕特部，俘获其王公不可计数，很快肃清青海地区切敌对力量。米剌印率所部五千精兵，仅用十五天，奔袭千余里，直捣敌穴，擒斩固始汗，创下殊功，因此封侯。
而占领西藏地区和硕特汗国经此役，损失惨重，特别是固始汗遭到顺军俘杀，直接造成和硕特汗国大规模内部纷争。
固始汗此时获悉西宁守军兵力薄弱，于是带领万部众突击西宁，军至城下，成功包围郭君镇。
但郭君镇镇定自若，组织百姓坚守城池，并亲自领兵夜袭敌营，大获成功。
不久米剌印率军赶到，顺军对西宁附近地区和硕特军展开猛烈攻击，同时开始招降活动。在大顺军攻击下，固始汗占据据点和寺院逐个丧失。
青海地区最重要喇嘛教寺庙塔尔寺也被米剌印攻破，众多很有威望大喇嘛被迫投降，结果被郭君镇下令概处死，参加叛乱喇嘛僧众也遭到严厉镇压。
在和硕特军节节败退、部分参加叛乱蒙古王公纷纷投降情况下，固始汗于十二月将扣压顺朝使者送还大顺军，并附疏上奏朝廷，为自己开脱罪责，请求议和。李来亨对此置之不理，下令大顺军平叛到底，必取固始汗首级方能回师。
固始汗当初将八个儿子留在青海，护卫汗国，建立八台吉军队，将青海划分为左右两翼。
如今左右两翼兵力都遭到大顺军毁灭性打击，基本上被尽数歼灭，和硕特蒙古势力从青海地区全盘退出。
和硕特汗国势力范围就此退缩到
顺军继续清除西宁附近叛军，很快收复镇海、申中、南川、西川、北川等地。固始汗被迫率领残部向西溃逃。当米剌印等率领三千顺军进攻郭隆寺时，遭到这里万余名喇嘛僧众顽强抵抗，战斗异常激烈，可僧众没有正式军事训练，死亡惨重。
众多黄教喇嘛逃跑后被顺军俘获，押解入京，李来亨亲自下令，对其律处以死罪，传首青海、西藏等地。
郭隆寺之战是平定青海和西藏之役中最激烈战役，用郭君镇话说：“自灭清以来未有如此大战者。”
固始汗在西宁附近战败后，率部退逃到离西宁千里之遥柴达木河带。在这种形势下，郭君镇提出于四月草青时，四路并进合攻青海作战方案，而米剌印则提出乘春草未生，以精兵五千、马万匹，乘敌不备、远程奇袭作战方案。
郭君镇将两种方案并上报朝廷，李来亨最终采纳米剌印作战方案。这样，大顺军便分三路向柴达木进剿。
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