沙州守军本就只有
千多人而已，城中居民又皆非汉人，难以进行有效动员，旦居民叛变，内外夹攻之下，势必全军覆没。
守将张国武系前明宣大边军出身
军将，参加过国初抗清战争数场大规模会战，又长期在东北、西北边疆地带任事，极富胆识。
他根据当地土著习俗传统，先是向百姓解释
顺朝治理政策，又向他们渲染准部破城以后势必劫掠定居百姓财产习惯，最后同城中土著大户豪族，于神前礼拜结义，安定沙州城内部局势。
千多人驻守沙州，康大眼领兵二千多人驻守哈密。由于嘉峪关以外，沙漠广布，道路难寻，城市依靠绿洲维系生存，相互之间仅有可供小规模商旅通行商路，大军互相难以联系。
准部侵入哈密后，柴达木盆地西北各绿洲小镇迅速沦陷。车臣率领万帐部落迁徙大军，沿着金山北麓直接挺进向嘉峪关方向。
负责驻守嘉峪关外顺军最大据点瓜州城守军将领，由于强行推行编户齐民政策，同当地回回、蒙古土著不和。当获悉准部逼近瓜州时候，顺军守将又强迫城外百姓放弃田宅撤入城中，对于不愿撤走者，则强行放火焚毁其房屋。
这样做法导致车臣绕行金山北麓，突然抵至瓜州城下时候，城内回回、蒙古土著便趁机发起反叛，杀害顺军守将及全城汉人将士、官佐以后，开城迎接准噶尔军入城。
瓜州是大顺在关西最大驻防城市，守军有四千人之多，竟然这样轻而易举地被准部攻占。
而且瓜州处在沙州和哈密城后方，是前线顺军联系嘉峪关必经要点，瓜州沦陷以后，还驻留在哈密最前线张国武、康大眼两部，便成为孤悬于外海外偏师，陷入孤立无援、弹尽粮绝困境。
刘芳亮闻讯以后，首先向朝廷上书请罪，李来亨不许，反而继续授予刘芳亮便宜行事专任大权。
刘芳亮随即下令免除处置不力甘肃省观察使、营田使和都捕盗使等人职务，重新请求朝廷委派得力*员赴任，同时将顿兵不前、增援瓜州不力嘉峪关守将逮京下狱，启用大批出身讲武堂少壮派军官任事。
完成内部整顿同时，刘芳亮又派遣李懋亨督军出关，负责起收复瓜州和救援沙州、哈密两城重任。
其时准军调集大兵，正在围攻弹尽粮绝沙州城。
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