大顺在这
带直接设置
郡县州府，进行流官管辖。过去统治哈密带
回部土司、蒙古游牧部落，其牧民被迁徙到青海放牧，农民则留居本地，由大顺委派官吏实行编户齐民直接管理。
为保障安定，李来亨下令改沙州为敦煌府，将哈密府、敦煌府、瓜州、安定州都编入甘肃省建制内，并将甘肃省省会由兰州迁至更靠西面甘州（即张掖）。
在吐鲁番带，则承认当地回王世袭权力，任命其为火州都督府都督，封哈密郡王，并派遣大顺流官出任火州都督府副都督实行监督责任。
西域北疆是指天山以北地区，基本上以游牧为主；南疆则是指天山以南地区，基本上以绿洲农业为主。
三疆之中，东疆地区最靠近中原，因而般是比较亲中原王朝地区，同时通常也是中原王朝经略西域桥头堡。
顺准两军在伊犁河谷连续激战五天四夜之久，最终以准军全线溃败，逃亡葱岭以西告终。
至此大顺军彻底实现远征天山、直抵伊犁战略目标，实现深入虎穴、犁廷捣巢任务。
当这消息经由蒙古牧民传到漠北时候，僧格浑台吉闻讯惊愕病倒，原本臣服于准噶尔人喀尔喀诸部，见此情形，也在当地大喇嘛带领下选择向顺朝投降。
僧格浑台吉手下虽然还有三万骑兵力，但是由于喀尔喀盟友叛变，再加上天山老家丧失，全军上下士气低落，部众星散，不复为伍，未经战，便有上万部众相继逃散。
安东大都督府所辖东军也适时地抵达战场，给僧格浑台吉最后致命击。
汉代以降无不是从这里开始进入西域脚步。唐代征服西突厥就是从伊吾归附和灭高昌开始。
当统治稳固下来之后，唐代在这里设置伊州、西州，所以大顺也是首先在哈密带设置大顺流官直接掌控敦煌府、哈密府，及其治下县厅。
对于依附顺朝，为顺军远征天山提供大量帮助哈密回王，则允许其世袭统治吐鲁番地区，并封以世袭罔替郡王头衔，并且每年都会予以大量金银赏赐，哈密回王子女也多赴开封求学任官。
而在北疆地区，这里主要是草原游牧地区，古代唐军进入之前是西突厥核心地区，大顺军进入之前是准部腹心之地。
唐廷在征服北疆草原之后，设置北庭都护府。唐廷对于北庭地区控制反复是比较多。对于西突厥旧部（左右厢咄陆、毕失努各五部），唐
安东军在叛降喀尔喀诸部协助下，长驱直入，抵达和林，将准噶尔余众击溃，生擒僧格浑台吉，将其押送回京，同多尔衮样发配山东修黄河去。
大顺军荡平准噶尔汗国役，用兵行军快如闪电，刘芳亮大胆挺进，为收获最后全胜之功打下定锤之音。
自此西域三路全部重归中国版图，朝廷得到战胜之讯后，立刻听从刘芳亮建议，任命李懋亨为安西大都督府大都督。
对于西域东疆、西疆、南疆三个边疆地区，则按照此前在黑水营战死果毅将军吕泽遗策，采取分而治之手法。
东疆地区，即东天山南北哈密、吐鲁番和巴里坤等地。这地区在东天山以北是游牧地区，东天山以南哈密、吐鲁番是农耕地区。
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