。苹果
股价不断下跌，到2003年3月，连新期权也都泡汤
，乔布斯索性把期权直接换成价值7500万美元股票，这相当于他从1997年回归苹果到2006年持有期结束，每年从苹果获得830万美元左右报酬。
这
切本来不会产生太大影响，但在2006年，《华尔街日报》推出关于期权回溯系列报道，引发巨大争议。虽然该报道中并未提及苹果，但苹果董事会还是专门组建个三人委员会来开展内部调查，这三个人分别是美国前副总统阿尔·戈尔、谷歌首席执行官埃里克·施密特、曾在IBM和克莱斯勒担任首席财务官杰里·约克。戈尔回忆说：“
们开始就决定，如果史蒂夫有错，们定会秉公处理。”委员会发现乔布斯和其他高管存在些违规行为，并立即将调查结果提交给美国证券交易委员会。报告称，乔布斯对期权回溯行为是知情，但他自始至终未从中获得经济利益。（迪士尼个董事委员会也发现，在乔布斯管理下皮克斯公司也发生过类似期权回溯行为。）
回溯操作相关法规相当模糊，而且苹果确没有人从这些可疑授予日期中获益。美国证券交易委员会花8个月调查此事，于2007年4月宣布不对苹果提起诉讼，“部分原因是苹果在本委员会调查过程中，提供迅速、全面、出色合作，进行及时快速自报告”。尽管美国证券交易委员会发现乔布斯事先知道回溯操作情况，但最终认定他并无任何不当行为，因为他“并不解此事会造成会计影响”。
不过，美国证券交易委员会对当时担任董事苹果前首席财务官弗雷德·安德森和法律顾问南希·海宁提起投诉。安德森是名退役空军上尉，下巴方方正正，为人极度正直，他在苹果有种睿智而沉稳影响力，以能控制住乔布斯脾气而闻名。他因另批期权文书工作（与乔布斯期权无关）被美国证券交易委员会认定为负有所谓“失职”责任，但证券交易委员会仍然允许他继续在苹果公司董事会任职。不过，他最终还是从苹果董事会辞职。
安德森认为自己被当成替罪羊。在与美国证券交易委员会达成和解时，他律师发表份声明，将部分责任归咎于乔布斯。声明中说，安德森曾“提醒乔布斯先生，高管团队期权必须以董事会实际批准当日价格为执行价格，否则可能会带来会计费用”，而乔布斯却回答说“董事会事先批准”。
海宁最初对于针对她指控予以反驳，但最终也以和解收场。她支付220万美元罚款，而没有承认或否认任何不当行为。同样，苹果也在项股东诉讼中达成和解协议，同意支付1400万美元赔偿金。
《纽约时报》乔·诺塞拉撰文指出：“这些问题本可以避免，但之所以会接二连三地出现，是因为某人太在意自己形象，这种情况实属罕见。不过话说回来，毕竟他是乔布斯。”乔布斯蔑视规则和条例，他营造风气让海宁这样人很难违背他意愿。有时，他会展现出伟大创造力，但他周围人可能会因此付出代价。特别是在薪酬问题上，因为难以抗拒和违背他奇思妙
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