格罗夫斯勘查现场后突然宣布：“就是这儿
。”
没过两天，军方就开始准备购买这所学校所需
文书，4天后，从华盛顿出差回来奥本海默带着麦克米伦和欧内斯特·劳伦斯回到这所学校视察，这里已经有
个代号——“Y地”。奥本海默穿着牛仔靴，带着劳伦斯参观学校建筑。为安全起见，他们自
介绍时用是假名。但是洛斯阿拉莫斯位学生斯特林·科尔盖特认出这些科学家。“们突然意识到战争已经来到们身边，”科尔盖特回忆道，“来两个分别叫史密斯先生和琼斯先生人，个戴着顶馅饼式毡帽，另个戴着顶普通帽子，这两个家伙旁若无人地走来走去，就好像这里是他们地盘。”科尔盖特是名高中生，他学过物理学，在教科书上看到过奥本海默和劳伦斯照片。不久之后，支由推土机和建筑工人组成队伍涌入学校操场。奥本海默对洛斯阿拉莫斯如指掌，从这里骑马40英里穿过高原就可以到达佩罗卡连特，而他和弟弟已经在许多个暑假骑马游览过赫梅斯山脉。
奥本海默终于能尽览桑格雷-德克里斯托山脉壮丽景色，格罗夫斯将军则得到处与世隔绝绝佳地点，那通向外界只有条蜿蜒砾石路和条电话线。在接下来3个月里，建筑工人们用木瓦或铁皮屋顶建造廉价营房，还有简陋化学和物理实验室。所有东西都被漆成军绿色。
当时，奥本海默似乎并没意识到洛斯阿拉莫斯已经片混乱，尽管多年后他亲口承认：“要为这个美丽地方被毁承担责任。”由于忙着招募项目所需科学家，他没有时间参与小镇建设日常事务。约翰·曼利是位实验物理学家，也是奥本海默在这里助手，他对这个选址充满疑虑。因为1942年12月2日从意大利流亡到美国物理学家恩里科·费米率领团队在芝加哥进行世界上首次受控链式核裂变反应，而不久前曼利就在那里，芝加哥是座大城市，拥有所著名大学、世界级图书馆，以及大批经验丰富机械师、玻璃吹制工人、工程师和其他技术人员，洛斯阿拉莫斯则无所有。曼利写道：“们试图在新墨西哥州荒野上建立个全新实验室，这里没有任何基础设施，只有骑马用装备和个图书馆，图书馆里尽是牧场学校孩子读书，比如霍雷肖·阿尔杰作品，所有这些对们制造产生中子加速器都没什
用处。”曼利认为，如果奥本海默是名实验物理学家，他就会明白“实验物理学九成靠是设施”，他也绝不会同意在这样环境中建造个实验室。
这里后勤工作极其庞杂。奥本海默和首批科学家计划于1943年3月中旬抵达洛斯阿拉莫斯。奥本海默向汉斯·贝特保证，到那时这里将是个由市政工程师管理宜居社区，会有单身宿舍和为已婚人士准备住宅，这种住宅从居到三居不等。这些配备家具住所都有电力供应，但出于安全原因将不会安装电话。厨房将配备燃木炉灶和热水器，房间里有壁炉和冰箱。家务劳动繁重时还有帮佣。这里将建设所幼儿学校、座图书馆、间洗衣房、所医院和个垃圾站。陆军营地
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