质疑：“1931年，
看到
那些日本人轰炸上海市郊
照片，从那时起就强烈反对轰炸。你投下
颗炸弹，它会落到坏人身上，也会落到好人身上。人们根本就来不及逃生。你多
小心也无法幸免，你为人正直也难逃劫……在与德国战争中，们在辐射实验室确实参与研发与爆炸有关装置……但这是面对真正敌人和严峻局势。原子弹却将这个原则推向极端，当时就不喜欢这个想法，现在仍不喜欢。认为这很可怕。”以拉比思维方式，赢得这场战争可以用种远没有那新奇技术——雷达。拉比回忆说：“想想，然后拒绝他。说：‘非常看重这场战争。如果雷达系统不够强大，们也可能会输掉。’”
拉比拒绝加入这个项目其实还有个更深层理由，这个理由并不是出于对现实考虑。他告诉奥本海默，他不想让“300年来物理学结晶”成为种大规模杀伤性武器。这是个非同寻常声明，而且拉比认为对于像奥本海默这样富有哲思人，这说法可能会引起他共鸣。如果说拉比已经在思考原子弹在道义上可能产生后果，那身处战争中奥本海默则破天荒地对形而上思考失去耐心，现在他对朋友反对置之不理。“认为，如果也像你样认为这个项目是‘300年来物理学结晶’，”他写道，“会和你有不同看法。对来说，这个项目就是在战时研发出种意义重大军事武器。认为，面对纳粹，们别无选择。”对奥本海默来说，现在重要事情只有件：赶在纳粹之前制造出这种武器。
尽管拉比拒绝搬到洛斯阿拉莫斯，奥本海默还是说服他参加这里第次学术研讨会，并在此后成为该项目极少客座顾问之。正如汉斯·贝特所说，拉比成“奥比慈父般顾问”。“从来没有从洛斯阿拉莫斯领过薪水，”拉比说，“拒绝这样做。想把们关系搞得清清楚楚，不是他们那里任何重要委员会成员，也未担任任何类似职务，只是奥本海默顾问。”
不过，拉比在说服包括汉斯·贝特在内许多人搬迁到洛斯阿拉莫斯过程中发挥重要作用。他还敦促奥本海默任命贝特为理论物理学部门负责人，他称这个部门为“项目神经中枢”。在这些问题上，奥本海默都相信拉比判断，并对他言听计从。
当拉比警告他在普林斯顿大学工作物理学家团队“士气越来越低落”时，奥本海默决定把那里20名科学家全部调到洛斯阿拉莫斯。事实证明这是个特别幸运决定，因为普林斯顿团队中不仅有罗伯特·威尔逊，还有位才华横溢、调皮可爱物理学家，他就是理查德·费曼，当时他才24岁。奥本海默眼就看出费曼天资过人，想让他去洛斯阿拉莫斯。然而，费曼妻子阿琳正在与肺结核作斗争，费曼明确表示，没有她在身边，他就不能搬到洛斯阿拉莫斯。费曼本以为事情就此打住，但在1943年年初，他接到奥本海默从芝加哥打来长途电话，他说在阿尔伯克基为阿琳找到家肺结核疗养院。奥本海默向费曼保证，他可以平时在洛斯阿拉莫斯工作，周末去看望阿琳。费曼
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