自私基因理论核心中有个矛盾很令人不安，这个矛盾存在于基因与生命
载体——生命体之间。
方面，
们已经得到个漂亮故事：独立DNA复制因子如羚羊般灵活，它们自由奔放地随世代相传，在次性生物容器中临时组合，而不朽双螺旋则不停改组演替，在形成终将腐朽肉体时磨炼，最终走向各自永恒。另方面，如果们只观察生命个体本身，每个生命都是台自成体仪器，它完美无缺，复杂精密，却又统结合，组织紧密。生命体并非只是个松散临时基因组合所构成产品。在精子与卵子即将开启个新基因混杂过程时，这些天人交战基因载体们并非刚刚认识彼此。生命体以其专注心大脑，协调着肢体与感觉器官进行合作，以完成各种生物目。作为载体，它工作已臻极致。
在本书些章节里，们已经考虑过将个体生物看做个载体，这个载体任务是努力扩大传递基因成功率。们想象个体动物进行着复杂考虑，计算着各种行为基因优势。但在另些章节里，这些基础理性思维则是从基因角度出发考虑。如果失去
基因角度，生命体便失去“关照”其繁衍成功率与亲属理由，而会转而考虑其他因素，比如它自身寿命。
这两种对于生命思考方式之间矛盾如何解决？曾经在《延伸表现型》书中尝试回答这个问题。这本书是职业生涯中最高成就，是骄傲与乐趣。本章节是该书几个主题简要概括，但更希望你们合上现在手中这本书，打开《延伸表现型》开始阅读。
达尔文主义自然选择般不直接作用于基因本身。DNA隐藏于蛋白质中，包裹于细胞膜里，与世隔绝，不为自然选择所见。即使自然选择试图直接选择DNA分子，它也找不到任何选择规则。所有基因看似相同，就像所有磁带在外表上看来都无甚区别样。它们不同之处在于其在胚胎发育过程时发挥作用，还有进而对生物体不同外表与行为作用。成功基因对胚胎有良性影响，即使环境中还有许多其他基因也同时作用于同个胚胎。这里良性影响指是它们让胚胎有可能成功发育为健康成人，而此成人则有可能制造后代，将相同基因传递给子孙。有个专业词汇“表现型”，专用于基因生物表征，也就是个基因相对于其等位基因在发育中对生物体作用。举个例子，些基因表现型为绿颜色眼珠。不过事实上，大部分基因都有超过个以上表现型：比如绿眼睛和卷发。自然选择会偏爱某些基因而摈弃另些基因，这取决于基因作用结果——表现型，而不是基因本身。
达尔文主义者通常只选择那些表现型有助于或有害于生物体生存或繁殖基因予以讨论。他们倾向于不考虑基因本身利害。部分原因是这个理论核心矛盾。比如，某个基因也许有助于提高捕食者奔跑速度。捕食者身体——包括所有基因——都会因其较快奔跑速度而获得成功，它速度有助于其生存、繁衍后代，更多地传递自身基因，包括那个加快奔跑速度基因。理论矛盾迎刃而解，于基因有利者亦有利于整个生命体。
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