科研积极性，出
批学术成果，还创办学术刊物《敦煌研究》。
段先生改变敦煌学研究核心主要是藏经洞文献研究认识，提出还应包括敦煌石窟研究。敦煌学研究中敦煌石窟研究，也成为国际显学热门，越来越多国内外学者参与其中。段先生带领敦煌研究院学者以及全国敦煌学界学者共同努力，改变“敦煌在中国，敦煌学在外国”状况。
段先生格外重视讲解员培训。因为那时候敦煌石窟已经正式对国内外游客开放。段先生认为敦煌石窟开放必须做好讲解，没有讲解，游客既看不懂，也看不好。敦煌讲解员应该可以运用不同语言给外宾做讲解。20世纪80年代初，研究院招聘批青年人当讲解员，段先生还亲自为他们讲课，也安排
和其他专业人员给讲解员讲课。后来慢慢在敦煌研究院形成学者为讲解员授课制度。学者们把自己研究成果介绍给讲解员，以提升讲解员知识水平。与此同时，还要求每个讲解员要掌握门外语。敦煌石窟自1979年开放以后，开放接待效果较好，直受到游客好评。
到80年代中期，也是在段先生努力推动下，日本z.府无偿捐赠，建设“敦煌石窟文物保护研究陈列中心”（即博物馆），实现段先生愿望。他还多次积极推动到日本、法国、印度等国及中国香港和中国台湾地区举办敦煌艺术展，每次他还要配合展出做不同内容敦煌讲座，使敦煌艺术对外影响不断扩大。总之，在段先生主持敦煌研究院工作期间，敦煌石窟保护、研究和弘扬各项事业上个很大台阶，极大地推动中国敦煌学发展，使敦煌这个边远地区小城为世界所瞩目，这段时期是他人生最辉煌页。
段文杰先生作为敦煌研究院开创者之，在极为艰苦条件下，与常书鸿先生等前辈道开创敦煌石窟保护研究事业。段先生以他生诠释“坚守大漠、勇于担当、甘于奉献、开拓进取”“莫高精神”。
很多人都知道段先生个梦。90年代初，他住院期间在病榻上做过个与敦煌飞天相遇梦，那个梦太动人、太美好！后来，他退居二线任名誉院长后，住到兰州他儿子那里，据他儿子说他时常“闹着”要回敦煌，不愿在兰州，时常做梦还在敦煌。2006年，他再次回到敦煌，特别兴奋，进洞窟，精神抖擞地给陪同人员滔滔不绝地讲解。见到，反复叮嘱要把敦煌石窟保护好、研究透、弘扬好！段先生心中有着根深蒂固敦煌艺术和敦煌事业情结，他心中爱着敦煌、装着敦煌、想着敦煌，直到生命最后刻！
段先生这代莫高窟人总是让们想起孔子盛赞颜回那段话：“箪食，瓢饮，在陋巷，人不堪其忧，回也不改其乐。贤哉回也！”个人能够做到宠辱不惊、安之若素、得之淡然、失之泰然，非有至高精神境界所不能。画画时候就画画，喂猪时候就喂猪，该思考美学就思考美学，该埋头种地就埋头种地，该做学问就做学问，能够在厄运到来时，处变不惊，念不生，这真是种“真者不虚，如者不变”境界。
段先生说：“画入眼中，万事离心头。”
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