当然，也有另
种说法。因为大瘟疫
爆发和传播，几乎和清军进军时间、路线是完全吻合。所以当然也就流传出
，这是清军随军携行萨满巫师，使用妖术在摧残明朝元气。有官兵亲眼看到满洲人把符咒和绘有神鬼图像木桩，埋在城隍庙下。
这种说法看起来是无稽之谈，但其实颇有依据。因为清军进军路线，就是条杀戮路线，沿途尸横遍野，很容易就成为瘟疫策源地。而清军队伍里数量不少蒙古人，还可能从草原上带来带有病毒老鼠和跳蚤，成为病原体传播者。
大瘟疫同时对明朝和正在北直隶带活动清军造成极大影响，阿巴泰早前就已经向河间府带北上。而直逗留在黄河流域图尔格，他虽然口口声声号称要南下向闯军复仇，可实际上却畏惧于闯军兵势，借口大瘟疫到来终于也准备撤回关外。
疫情以人口最密集京师和清军逗留最久黄河沿岸最为严重，所以无论是阿巴泰和图尔格都制定条绕开京师撤回关外路线。
大疫改变清军进军方向，
崇祯年间，各地发生大疫并不算什
新鲜事。崇祯九年，延安就发生过大疫；十二年，也就是李自成潜伏商洛那年，陕西遭遇蝗灾，饿死者僵尸遍野，疫气弥散，又曾引发大疫；十四年，京师、河南均发生大疫，死者无数。
然而，今年直隶大疫却特别严重，不但持续时间长，蔓延范围广，死者极多，而且发生许多离奇古怪事情。
这些事情在京城四处被加油添醋地迅速传播，更给全城增添恐怖气氛。
大疫是在秋天开始发作。
传说天晚上，保定夜巡者在街头突遇位老人。老人叮嘱他们：“夜半时分，有个身缟素、哭哭啼啼妇人会从这里向东走去。你们千万要拦住。如果让她过去，会有灾祸临头。只要等到鸡鸣，事情就过去。
是这里土地神，故来相告。”
到半夜，果然自西向东走来这个妇人。夜巡者当即予以拦阻。五更过后，巡逻士兵偶尔入睡，妇人乘机向东边走去，旋即返回。她用脚将个士兵踢醒，说：“是丧门神，上帝命来惩罚此地，你怎能听老头话来拦？灾难就从你开始！”说罢人就消失。士兵害怕，奔回家中告诉家人，话还没有说完就倒地身死，而北直隶大瘟疫就从那天开始。
疫情持续数月，到十月底变得格外严重，死者累计已达二十余万。因为许多患者身上长出疙瘩，所以疫病又被称为疙瘩病。这时各种传言更多，有些事情是有名有姓。
如个叫曹良直小京官，正在家中向客人敬茶，突然歪下去死。个刚被授为温州通判宜兴人吴彦升，家中个仆人死，另仆人去买棺材，竟死于棺材店。名姓不详传闻则更多，如说两个偷儿，个入室行窃，个爬在屋顶上接赃，下面人刚刚把窃得包袱托上去，上面人刚刚接住，两人突然同时死去，而财物还悬在空中。
又说有新婚夫妇于成亲之夜同死于床上。
更怪异是说有鬼物白天出行，用银子都是纸变成。这个谣传出，许多商铺都赶紧在店内放置水盆，收到银钱后就丢进盆里，由钱沉浮区别人鬼，判明真假。
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